Ихтиологическое отделение было организовано в 1973 году. Заведующим отделением из двух групп Т-101 и Т-102 специальности «Технология рыбы и рыбных продуктов» стала Левченко Э.М.
В 1975 году отделение получило дальнейшее развитие. Заведующим отделением стал Сороки В.В. Ряды преподавателей пополнились за счет специалистов-преподавателей: Астахова А.Е.(начальник консервного цеха), Евсеева И.В. (микробиолог лаборатории рыбного завода).
С 1975 по 1997 отделение выпускало специалистов техников-технологов, технологов-консервщиков (3 группы) и технологов-бухгалтеров (4 группы). Качественной подготовке техников-технологов способствовала широкая база практики. Юноши, прошедшие КОНКУРС по результатам учебы, визирование, уходили на практику в море из городов: Новороссийск, Керч, Севастополь, Таллин, Калининград. Другая часть студентов проходила практику на рыбообрабатывающих предприятиях городов: Москва, Ейск, Керчь, Ялта, Таганрог, Бердянск, Мариуполь, Азов, Астрахань, Адлер, Пицунда, Сухуми, Поти, Таллин и др.
С 1997 года (заведующий отделением Астахов А.Е.) помимо техников-технологов техникум стал выпускать техников-ихтиологов, а с 2001 года техников-экологов. Студентов этих специальностей отделение подготавливает по настоящее время. Подготовка специалистов на отделении ведется в соответствии с Государственными образовательными стандартами. Выпуску подготовленных специалистов способствует хороший педагогический коллектив преподавателей отделения, имеющих высшую и первую квалификационные категории.
Всего ихтиологическим отделение техникума выпущено 2020 человек (из них 334 с красными дипломами).
Студенты ихтиологического отделения техникума принимают участие в научных конференциях, конкурсах.
Победители получают различные награды: дипломы, грамоты и т.д.

НАПРАВЛЕНИЯ ПОДГОТОВКИ:
- 35.02.10 Обработка водных биоресурсов
- 35.02.09 Ихтиология и рыбоводство
- 20.02.01 Рациональное использование природохозяйственных комплексов

НОРМАТИВНЫЕ ДОКУМЕНТЫ
- Положение об ихтиологическом отделении
-Копия локального нормативного акта, регламентирующего порядок отчисления, восстановления и предоставления академических отпусков обучающимися по образовательным программам высшего образования и по программам подготовки специалистов среднего звена по специальностям среднего профессионального образования;
-Копия локального нормативного акта, регламентирующего порядок оформления возникновения, приостановления и прекращения отношений между ФГБОУ ВО «АГТУ» и обучающимися и (или) родителями (законными представителями) несовершеннолетних обучающихся
-Копия локального нормативного акта, регламентирующего формы, периодичность и порядок текущего контроля успеваемости и промежуточной аттестации обучающихся;
-Копия локального нормативного акта, регламентирующего проведение государственной итоговой аттестации по образовательным программам среднего профессионального образования